過量施磷會誘發土壤缺鋅過量施用磷酸鈣后，會使土壤里的鋅與過量的磷作用，產生磷酸鋅沉淀，令作物無法吸收，使作物出現明顯缺鋅癥狀；過量施用鈣鎂磷肥等堿性磷肥后，會使土壤堿化，使鋅的有效性降低，影響作物對鋅的吸收。

過量施磷會使作物失硅據研究，過量施用磷肥后，還會造成土壤中的硅被固定，不能被吸收，引起作物缺硅，特別是對喜硅的禾本科作物的影響更大。如喜硅作物水稻，若不能從土壤中吸收到較多的硅元素就會發生莖稈纖細、倒伏及抗病能力差等缺硅癥狀。

過量施磷會使作物缺鉬適量施用磷肥，會促成作物對鉬的吸收，但過量施用磷肥，卻會使磷和鉬失去營養平衡，影響作物對鉬的吸收，表現出“缺鉬癥”。

過量施磷易造成土壤中有害元素積累磷肥主要來源于磷礦石，磷礦石中含有許多雜質。其中包括鎘、鉛、氟等有害元素。而且施用磷肥會引起土壤中鎘的增加，這種鎘有效性高，易被作物吸收，會給人畜造成危害。

過量施磷肥會造成土壤理化性質惡化過磷酸鈣含有大量的游離酸，連續大量施用，會造成土壤酸化。鈣鎂磷肥含有25%-30%的石灰。大量施用會使土壤堿性加重和理化性質惡化。

那么磷肥施用量以多少為宜呢？一般來講，即使缺磷土壤，每畝施用量也不能超過40公斤，以30—35公斤為宜。